【story — 剧情介绍】
第1话 【袭击】
在沿海的小村子米罗村里，少年路吉和村人们从海里发掘的一台大型的ZOIDS，大家正为此高兴但是却没人能启动这台ZOIDS，路吉的弟弟法吉劝路吉去开动这台ZOIDS，但是路吉以自己没有适应性拒绝了。在村民们决定把ZOIDS卖掉的时候，数台银色的ZOIDS袭击了村子，无意之下路吉启动了这台ZOIDS“狮虎村雨”，在解决了一台银色ZOIDS的时候，又有2台ZOIDS出现了….
第2话【生物ZOIDS】
在拉-坎和弥的帮助下，路吉击败了来袭的银色ZOIDS，正在旅行的拉-坎告诉村人们银色的ZOIDS名叫“生物ZOIDS”，这种ZOIDS实弹和光炮是无法击败的，只能用稀有的“利奥”制式武器才能砍伤。另一方面，帝加路特军的哉利因为行踪不明的ZOIDS小队而来到了米罗村。
第3话【启程】
路吉与哉利的战斗异常艰难，但是在拉-坎和弥的帮助下总算将生化ZOIDS击退了，但是在战斗的过程中路吉因为躲避攻击而使杰列烈塔损坏了。在拉-坎的提议下路吉决定一起去旅行寻找能修理杰列烈塔的工匠，于是路吉和拉-坎展开了他们的旅途。
第4话【初到的城市】
路吉一行人来到了商业都市雅拉哈德，对一切都感到新鲜的路吉在城里闯了祸，在神秘女性柯特娜的帮助下顺利解决了。其实柯特娜是赏金猎人，以路吉的ZOIDS为诱饵引出附近的ZOIDS盗贼，在路吉和柯特娜的协力之下终于将ZOIDS盗贼捉住了。
第5话【决斗】
在旅行的途上，路吉再次和柯特娜相遇了，柯特娜以帮路吉寻找工匠为理由让路吉赶走一直缠着她的卡拉卡，在一段戏剧性的骚乱之后，卡拉卡决定和路吉以决斗来决定柯特娜的归属（真是有够自作主张）。决斗的时候在正要发生伤亡的时候，拉-坎阻止了他们，和解之后卡拉卡却发现自己的同伴受到了迪加路特的袭击……
第6话【山中的秘密据点】
知道卡拉卡是反帝加路特军的成员后，大家都跟了上去。同时对战斗感到无聊的哉利也来到了附近并以卡拉卡的同伴为诱饵引出反帝加路特军，在柯特娜和路吉的联合侦查下发现了敌人的陷阱，在龙的计划下生化ZOIDS部队全部被歼灭，但是哉利却在地形的掩护下逃离了。
第7话【叹息之山】
初次尝到胜利的卡拉卡不禁得意起来，不听从大家和龙的意见撤离这个据点，并自作主张的将大家归为反帝加路特军的成员，虽然大家心有不满，在路吉的恳求下还是决定帮助他。帝加路特军再次向据点袭来，但是龙的策略已经被哉利看穿了，路吉他们反而陷入了困境，经过艰难的战斗，终于逃了出来。卡拉卡看着燃烧的据点和满是伤痕的同伴，流下了悔恨的泪水。
第8话【地下水路】
由于长期的逃离，ZOIDS的烈格鲁已经所剩不多了，路吉通过水路与哈拉女士取得了联系，哈拉建议路吉通过地下水路进入杰列烈塔取得烈格鲁。但是在返回的途中路吉却因为水流的关系被冲到了浴室，被正好在洗澡的哉利发现了（赤裸相见，囧一个），战斗之后大家马上逃走了。
第9话【温泉村】
路吉他们来到了温泉村沙库萨，在这里路吉见到了能修理ZOIDS的工匠金葛老爷爷，由于正忙，路吉与龙展开了一场比试，战斗之中虽然村雨的速度完全在班布里亚之上，但是龙以微弱的偏差躲过了路吉的攻击，战败的路吉很沮丧，卡拉卡开玩笑的说要当路吉的老师，但是龙却笑着说这样的话只会令路吉生存率下降…
对自己能力失望的路吉对于傍晚袭击村人的象型ZOIDS耿耿于怀，但是路吉却敌不过巨大的象型部队，就在狮虎村雨要被踩碎的时候，一台虎型的ZOIDS瞬间将周围的象型部队撕碎了…….
第10话【迷茫】
拯救了路吉的人是拥有“史上最强ZOIDS驾驶员”之称的塞修罗，他和他的爱机“索路泰卡”，路吉知道以后马上请求塞修罗成为自己的老师，但是塞修罗因为自身的问题马上拒绝了。另一方面龙和卡拉卡发现象型ZOIDS的探测器被破坏了，担心ZOIDS会袭击村子的他们马上赶回沙库萨。在路吉一行人陷入苦战的时候，塞修罗把象型ZOIDS全部赶到了沟里。事后，路吉拜托塞修罗守护米罗村，塞修罗却说“自己的村子要自己保护。”成为了路吉的修行老师。
第11话【旅伴】
一方面路吉在塞修罗的修炼下一遍旅行（叠罗汉…），另一方面哉利回到了迪加路特的首都帝古，帝加路特军总司令的金给哉利放了假，派出了另一名大将杰欧路克追击拉-坎一行人。在雪山的当晚，弥因为长途跋涉而发了高烧，路吉为中午的时候与弥打雪仗而感到内疚而与塞修罗一起去采草药，经过这一事件后路吉和弥的关系似乎变得更好了……
第12话【潜入】
在矿山都市杰多鲁夫，一台角龙型的生化ZOIDS出现在战场上，角龙型的生化ZOIDS以压倒性的威力将大门打破，杰多鲁夫沦陷了……第二天，路吉他们来到了杰多鲁夫附近，再救下一台虫型ZOIDS之后知道了杰多鲁夫沦陷的事实，为了找到能修理杰列烈塔的工匠菲鲁迪，他们决定潜入杰多鲁夫……
第13话【支配】
潜入杰多鲁夫的路吉一行人成功混入了人群中，塞修罗和柯特娜被强行征去作为ZOIDS的驾驶员，而路吉则因为没有ZOIDS的适应性而被带去做干苦力活。当晚，杰多鲁夫的守卫赶回来要夺回自己的城市，但是面对他们的是一台机就歼灭了他们的杰欧路克，看着被毁灭的杰多鲁夫守卫的路吉心中发生了变化……
第14话【脱出】
潜入杰多鲁夫已经一个星期了，路吉一行人联系上了潜入杰多鲁夫的守卫，柯特娜决定配合守卫的行动带走菲鲁迪先生。在第二天的行动中，路吉他们进入了司令室但是却发现菲鲁迪先生已经因病去世了，面对数量众多的的生化ZOIDS，路吉只能无奈的逃离……
第15话【离散】
由于菲鲁迪已经去世，寻找工匠已进失去了意义，在大家迷茫的时候，路吉建议大家去解救杰多鲁夫的人民，但是这一说法却遭到了弥的强烈反对，你还为此和路吉打了起来……当晚路吉和守夜的卡拉卡潜入杰多鲁夫想要拯救杰多鲁夫的人，但是面对则鲁夫的问话路吉却发现自己想的太天真了，另一方面杰欧路克集中了周围所有的部队来歼灭拉-坎一行人，拉-坎一行人却因为没有人戒备而遭到了伏击。看到大火而赶回来的路吉看到的只有一片烧毁的森林……
第16话【相遇】
与大家失散的路吉遇到了是“反帝加路特军”（自称）的“无敌团”五人组，而后又与卡拉卡相遇了。看到“无敌团”那反对迪加路特的“行为”以后，卡拉卡和路吉不禁哭笑不得…
第17话【愤怒】
对于狮虎和迪特利空的加入，帝加路特军开始重视起来。帝加路特军设下了陷阱，看到自己的同伴一个个不断的倒下，最后连狮虎村雨也倒在了火山口中，卡拉卡失去了理智，卡拉卡解开了迪特利空的武器限制，进入了狂战士模式，解除限制的迪特利空疯狂的杀戮着帝加路特军……晓幸没掉入熔岩中的路吉看的迪特利空的行为，从驾驶仓中走出阻止了迪特利空的暴走。在路吉和卡拉卡正在心痛自己又再次没能保护自己同伴离开的时候，已经“死去”的“无敌团”团员却从废墟底下爬了出来……
第18话【合流】
在之前的战斗中受伤的拉-坎逃到了比库尔村，但是村民们却因为害怕帝加路特军军而出卖了他们，拉-坎不忍伤害没有战斗力的村民而被绑在了村中的广场上。就在拉-坎一行人要被处刑的时候，路吉和卡拉卡及时赶到了。
第19话【红莲】
与路吉合流的拉-坎决定马上离开比库尔村，面对村民们的请求，拉-坎谢绝了。在拉-坎离开以后，杰欧路克来到了比库尔村，不由分说就开始烧毁村子，面对帝加路特军这种行为，路吉一行人马上赶了回来，但是面对着生化角龙的力量，大家都不是对手，就在索德乌路夫要被生化角龙刺穿的时候，狮虎村雨发出了耀眼的火焰，在肉眼无法看到的光芒中生化角龙被切成了碎片…….
战斗结束后，在清晨的光芒中回荡的是疾风狮虎的咆哮以及那红色的身影。
第20话【决意】
在帝加路特军的的调查部队离开之后，路吉他们开始帮助村人修复比库尔村，在这个过程中路吉听到了村人们发出了对帝加路特军的恐惧和叹息，认识到不打倒迪加路特的话就得不到真正的和平，即使修复了杰列烈塔也不能保护好自己的村子。于是路吉拜托拉-坎做他们的领袖组成“反迪加路特讨伐军”，而拉-坎向大家说了他以前面对帝加路特军时逃跑的故事…最后决定以ZOIDS之间的战斗决定大家的去向。
而正在休息的哉利看到的是飞翔在空中的新型生物ZOIDS“生化普特拉”……
第21话【返乡】
无法决定大家去向的拉坎决定，回到米罗村，让米罗村的村民决定大家的去向。看到自己家乡荒废的路吉，更坚定了要摧毁帝加路特军的决心，但是除了父亲以外村民都对路吉的行为不给于理解，路吉的家人也遭到了村民们的冷眼对待。路吉和拉-坎为了表示歉意像每一位村民道歉，以期待他们的原谅。
第二天，在路吉他们离开的时候，所有的村民都笑着送走他们并祝福他们早日打倒帝加路特军…….
第22话【誓言】
决定组成迪加路特讨伐军的大家，来到了拉-坎的根据地利兹。在这里路吉知道了拉-坎为什么要旅行的原因，也知道了蓝斯塔古原来是你的父亲的机体，感慨之下跑去帮弥清洗兰斯塔古……
第二天，拉-坎在利兹发出了要创造和平能让任何人自由张开笑容的世界的宣言。
第23话【疾风】
为了组成迪加路特讨伐军，需要许多伙伴，拉-坎一边组织着城里的工作，一边发出发出信使联合大陆上的反迪加路特势力。路吉的训练已经逐渐有了成果，于是路吉被派去联络拉-坎以前的部下铁泽，在路上路吉的行踪被维勒妮发现了，一只生物速龙小队包围了他，危急之下路吉第一次成功以自己的意识变成了疾风长牙狮。突破了包围的路吉很快与铁泽会合了。
第24话【傲气】
在自己家乡休假的哉利看到自己家乡因为工厂的污染和自己幼年玩伴的惨状想起了自己当年加入帝加路特军的情景……
在源源不断来到的援军下，迪加路特讨伐军渐渐成形了（但是毕竟只是没有纪律的混合军）。一只生化速龙小队向兹利进发，迪加路特讨伐军很没有规律的出动了，迪加路特讨伐军马上陷入了苦战，但是在路吉的帮助下还是将敌人击败了。
击败了生化速龙的讨伐军不禁得意起来…….
第25话【进军】
路吉正在训练的时候，张开会议的钟声敲响了，然而讨伐军的各个领导者却为了“参加会议的人数是2人”这类问题而斤斤计较，会议在极不友好的气氛下进行着……最后一致决定在第二天向敌军进发。但是讨伐军的各个领导者对于拉-坎再三修改作战计划感到不满，然而这次作战其实是拉-坎为了向讨伐军显示帝加路特军的恐怖准备的作战（但是成功了的话也能成为巨大的战果），拉-坎已经准备好了撤退的路线。然而这一信息却被一个正在“放水”的游击队员听到了……
第26话【雾之河】
听到自己队员的报告，求功心切的白库早早就向敌人进发，察觉到白库已经出发的林格也私自赶了上去。然而拉-坎的计划早已被作为指挥官的哉利看穿了，偷袭反而因为埋伏而陷入困境，在大雾中讨伐军无法识别自己的同伴而自相残杀。象型部队全灭、林格战死、就连在空中的柯特娜也遭到了生化普特拉的袭击，为了打破僵局路吉决定击破河上的大坝将生物部队冲开，早已准备好的哉利与路吉展开了一对一的战斗，以毫厘之差路吉赢得了战斗打破大坝将敌人冲入河中之后，讨伐军却只剩下原来人数的一半。
第27话【再次开拓的道路】
战斗已经过去三天了，在雾之河战场上再也找不到活着的同伴了。而在帝古，哉利也终于从昏迷中醒来，原来他在梅加拉斯爆炸前被自己的老师兰博救出了，看着自己换装用的行李，哉利想起了自己被路吉打败的事实，不禁感到羞耻和愤怒（这是哉利在首次被人打败）。另一方面，大家在哀悼失去同伴的同时，更决定了要击败帝加路特军的想法，而龙的朋友也给大家的ZOIDS带来了新装备就在大家正高兴的时候，在帝古的哉利也被金给与了新机体-“生化铠弩”，而沉醉在得到新机体的喜悦的同时却没发现金脸上露出了阴险的笑容……
第28话【传说】
“生化铠弩”的启动不是很顺利，不喜欢帝古空气的哉利决定到别处进行“生化铠弩”的实战实验。而路吉和弥被龙带到了城市尤库中，在这个城市的地底下，路吉他们见到了“看不见的墙”、“发光的天花板”、“突然出现的歌手”等前所未有的事物，也从龙那里听说了关于史前的故事。在“生化铠弩”的启动试验中，哉利不知道为何变得十分好战，而他也没发现自己的变化，被“生化铠弩”的攻击发出的光芒吸引的路吉与哉利发生了战斗，但是村雨的攻击对“生化铠弩”完全不起作用，连疾风也败在了“生化铠弩”的强大战斗力之下危急之中弥帮路吉挡下了一击才成功逃跑了，无法顺利操纵“生化铠弩”哉利看着路吉逃跑，发出了愤怒的吼声……
第29话【秘密】
柯特娜和拉-坎回到了柯特娜的家乡，她的家乡是有着发掘秘密的话就会被诅咒的阿央鲁克，而柯特娜十分不想回到这里。在这里柯特娜遇到了自己的妹妹和以前的同伴，在被帝加路特军占领的阿央鲁克，柯特娜和拉-坎被帝加路特军抓住了，阿央鲁克的秘密就是ZOIDS的工厂，迪加路特的生化ZOIDS一部份就是在这里生产的，随后来到的琳娜知道了当年柯特娜逃离阿央鲁克是因为首领想让她们互相残杀决定继承者而和解了。与妹妹和解之后的柯特娜启动了工厂的自爆装置，靠着新装备的力量逃离了。
第30话【魔物之森】
卡拉卡和塞修罗为了要寻找组成讨伐军的同伴而来到魔物之森，但是在月光之下ZOIDS却不听控制跳起舞来。原来在有月亮的时候进入魔物之森的ZOIDS就会失去控制，无法前进之下只好在森林外面休息，这个时侯有一个奇怪的老婆婆出现了。老婆婆住在这个森林的深处，与老婆婆的谈话令卡拉卡感觉到自己应该冷静的对待战斗，数天后帝加路特军的生物ZOIDS前来袭击，在战斗的时候老婆婆的屋子被烧毁了，这时一台狼型的ZOIDS出现援助，战斗结束之后卡拉卡才发现原来老婆婆就是当布鲁。与卡拉卡约定好在利滋见面后，大家就分开了，卡拉卡问塞修罗为什么在屋子着火的时候能那么冷静，塞修罗就说老婆婆让他想起了自己的妈妈……
第31话【被留下的人】
在路途中，路吉遇到了是林格恋人的嘉宝露，她因为林格的死亡而将愤怒迁就到路吉身上，无奈之下龙提议两人以决斗的方式来决定事件的结果，在决斗中路吉却完全没有回手这时帝加路特军来到了，与帝加路特军战斗中路吉掩护了受伤的嘉宝露，战斗之后嘉宝露与路吉和解了，并约定要一起打到帝加路特军。
第32话【天空中的人】
哉利已经发现了路吉的行踪，想要向帝古申请支援，但是今天是“灵庭”开会议的日子，所谓的灵庭会议就是迪加路特皇帝与来自天空的人每月回报和交易的日子。对援军的等待不耐烦的哉利一个人开着生化铠弩出发了。另外路吉在龙的带领下来到了一个名为“卡恫”的城市，这个城市比一般的城市要发达（很接近现代的城市），在这里路吉听到了与“天空之龙”有关的另一个传说，并见到了“比山还巨大的ZOIDS” 基鲁多龙（别名“船盒”），了解到古代的人有一部份人为了逃离地面上的灾难而来到天空上生活，路吉也得到了卡恫全城人民的支持。坐上生化铠弩的哉利越发感觉到自己疼痛的时间增加了，对路吉的憎恨也越发增加，见到路吉之后马上扑了上去，面对强大的生化铠弩三台ZOIDS都完全不是对手，眼看长牙狮就要被生化铠弩撕碎龙毅然将班布里亚自爆来打倒生化铠弩……
第33话【预兆】
拉-坎召集同伴的行动不是很顺利，因为上次的失败没有人愿意加入讨伐军，50日的会师时间也快到了，拉-坎决定到迪奇皖补充烈格鲁就与路吉会和。在迪奇皖里柯特娜因为阻止索塔射杀平民而暴露了身份，在生化肯特的强大战斗力下索德乌鲁夫和凌波嘉克完全不是对手，索德乌鲁夫更是连烈格鲁也耗尽了。面对战斗力极强的生化肯特，路以疾风通过细微动作躲开了攻击，再以村雨的剑终于将生化肯特击伤。对自己力量感到不足的路吉深切感受到力量的重要性，这时脑袋里出现了拥有2把比村雨还强的剑的长牙狮。战斗结束后路吉把知道了班布里亚有备用的机体，也知道了在上次的爆炸中哉利并没有死去……
第34话【强袭】
兹利的战斗已经进行了一天，但其实这只是敌人的指挥官兰博为了晚上的奇袭而做的准备，在路吉他们回到兹利的时候帝加路特军已经发现了兹利的入口。当晚帝加路特军发动了奇袭，而白天被击倒的生化ZOIDS其实是为了奇袭而装作被打倒的，陷入伏击的讨伐军马上出击了，但是面对生化肯特无论是疾风还是村雨都无法战胜，在要保护大家的信念的支持下，长牙狮再一次进化了。面对力量完全在自己之上的无限长牙狮生化肯特轻易倒在了银白色刀刃之下，眼见战斗下去也没有希望的帝加路特军撤退了，而再一次挽救了大家的路吉成为了大家打败迪加路特的希望。
第35话【奇袭】
为了引起各地反帝加路特军的共鸣，再次组建迪加路特讨伐军，路吉制订了“帝古攻击方案”。这次作战的目的是从帝古被攻击的情况除了向各地的反帝加路特军证明讨伐军实力以外，也是为了打破帝加路特军在人们心中不可打败的形象。准备好的的路吉组织了大家拥有利奥武器的ZOIDS小队通过从卡恫得到的地图从北部山脉潜入了帝古附近，在毫无防备之下，路吉一行人从四方进入了帝古，在混乱之中卡拉卡破坏了ZOIDS的仓库，在仓库之中他们发现了从没见过的新型ZOIDS“生化普特拉尼”，为了阻止生化普特拉尼被破坏，金驾驶者尚未完成的生化库拉诺迎击了，在无限长牙狮的强大战斗力之下，大家安全的逃离了。虽然这次战斗并没有完全破坏迪加路特的工厂，但是各地的反迪加路特的热情却在悄悄上涨……
第36话【绽放】
帝古被蓝色长牙狮带领的讨伐军攻击的消息很快传遍了各地，各地的反帝加路特军势力的热情在飞快上涨着，向兹利进发的反帝加路特军势力逐渐增多。但是兹利里原吉达潘的居民却逐渐不满起来，因为兹利原本是为了重建吉达潘而建成的城市，而现在却成为了讨伐军的根据地，吉恩爷爷不知道该如何面对弥和拉-坎而烦恼。面对这种状况吉恩决定和路吉决斗来决定利滋以后的道路，战斗之中弥以公主的身份阻止了决斗，而路吉和吉恩的心情也传到了利滋民众的心里，而拉-坎也发誓在打败帝加路特军的时候就立即重建吉达潘。这时天空中传来了巨大的噪音……
第37话【袭来】
帝加路特军的空中部队终于完成了，首次攻击的目标就是讨伐军所在的兹利。缺乏对空战斗能力的讨伐军根本无法对生化普特拉尼造成巨大伤害，兹利化为了一片火海…….在兹利的伤民中弥遇到了失忆的索塔，面对失忆的索塔，弥很快和他成为了朋友并给他取了“银”这个名字，但是柯特娜认出了索塔就是之前生化肯特的驾驶员。因为记忆混乱而痛苦的银坐上了迪特利空并对村雨长牙狮发动了攻击，但是因为对村雨的恐惧而被打晕，自己家乡被迪加路特毁灭的村民愤怒的喊着要杀死银，但是见到年幼的银，大家却迷惑了……
第38话【突袭】
在烧毁的城市中，大家艰难地重建着，但是面对敌人的空军，大家却想不到反击的方法。在吉恩的恳求下，路吉说出了自己的攻击方案——让帝加路特军再次攻击兹利，而我军则组织一支精兵到生化普特拉尼停机厂的托拉夫将返航的部队一举击破。在全部人的努力下，兹利的伪装完成了，在诱导作战成功之后路吉连夜赶到了托拉夫附近，虽然中间有一点波折，但是作战还是成功了，在利奥飞弹的射击下机场和生化普特拉尼受到了巨大的伤害，这时候在路吉的带领下，大家冲向了托拉夫……
第39话【入城】
虽然敌方的空军受到了巨大伤害，但是在托拉夫密集的炮火和博兰司令的指挥下拉-坎只好命令大家撤退。第二天，大家决定趁托拉夫还处于混乱状态趁机攻击，在两台暴风剑齿虎的联合攻击下托拉夫周围的河流被蒸发成为了了掩护的大雾，在突击之前又有一发不明的炮击将空军击溃，托拉夫被讨伐军占领了。眼看局势无法挽回的维勒妮据定将城市的杰列烈塔破坏，对此感到愤怒的路吉在连续进化的战斗方式下将生化普特拉打伤，但是在自爆攻击的掩护下维勒妮还是逃跑了，然而因为托拉夫被占领，讨伐军获得了第一座自己占领的城市。而路吉在龙的带领下与天空的居民帕拉见面了，后悔向迪加路特提供了技术的帕拉向路吉提出了要联手打败帝加路特军的请求。
第40话【生化粒子炮】
听到托拉夫被占领的消息，更多的部队来到了托拉夫，其中还包括路吉和卡拉卡以为已经死去的无敌团，沉醉在相会的喜悦中的卡拉卡和路吉却遭到了弥和塞修罗的白眼……驾驶生化铠弩时间越长的哉利，身体越发衰弱和痛苦，来到托拉夫的哉利制订了以从四面包围和梅加拉夫小队突击的作战方案，但是却被路吉和塞修罗阻止了，执着的与路吉决斗的哉利在正要给村雨最后一击的哉利却因为身体不听控制而启动了生化粒子炮，对这种结果无法接受的哉利发出了愤怒的吼声，这时塞修罗用索路泰卡撞开生化铠弩躲过了致命的一击，无力战斗的哉利马上发出了撤退命令，在撤退的时候哉利对生化铠弩和金发生了怀疑……
第41话【政变】
自认有能力与“天空”决裂的金将迪加路特皇帝拉拉达三世谋杀成为了新一代的皇帝。而另一方面路吉因为忙于讨伐帝加路特军和工作与弥的关系逐渐疏远了，由于长期不休息和工作路吉的身体也渐渐疲劳，但是即使被弥和塞修罗教训，路吉也没发现自己的错误。而弥和银的关系却因为长期在一起而变得亲密。
第42话【密会】
因为长期战斗而疲劳的路吉被拉-坎下达了禁止出击的命令（但是这小子还是不知道自己该休息了）。而银因为怕寂寞和弥一起来到了前方的据点，而龙将同是监察者的维勒妮约了出来，看到生化普特拉的银想起了自己与维勒妮的记忆驾驶着兰斯塔古追了上去。龙质问维勒妮为什么不限制金的所作所为反而帮助她，还问了关于银的事情，但是维勒妮却说她是因为好玩才这么做，受到打击的银痛苦的跪在了地上……战斗中路吉因为太疲劳而昏倒，这时大家在柯特娜的带领下前来救援了。
醒来的路吉受到了大家的责怪，因为大家是同伴所以不需要一个人承担所有的负担，而银这时也被大家接受成为了同伴。吉恩急急忙忙跑来报告银逃跑的消息，却发现银正在给拉-坎画头像……
第43话【钥匙】
由于生化ZOIDS进入了量产，被占领的城市迅速被帝加路特军夺回，无法与帝加路特军横抗的拉-坎向“天空”提出了需要大量利奥制的炮弹的要求，而龙则对路吉说“你去和柯特娜结婚吧！”原来在阿央库鲁的地下有一台基鲁多拉龙，而柯特娜的真正名字就是启动基鲁多拉龙的条件之一，为了自己的同伴，柯特娜答应了。大家准备好好了就向阿央库鲁进发了。
第44话【离陆】
趁着讨伐军的进攻路吉、拉-坎和柯特娜潜入了阿央库鲁的地下，柯特娜见到的是荒废的城镇和被士兵追杀的妹妹。知道讨伐军进攻阿央库鲁的哉利为了和路吉决一胜负，即使抱有疑问还是再次坐上了生化铠弩。虽然在妹妹的帮助下柯特娜解开了基鲁多拉龙的封印，但是却无法启动它，听到基鲁多拉龙呼唤的银也来到了基鲁多拉龙上和柯特娜一起启动了基鲁多拉龙，无法忍受再次错过决斗机会的哉利在基鲁多拉龙的翅膀上和路吉展开了一对一的对决，但是生化铠弩却再一次自己行动起来，愤怒的哉利以自己的意志令生化铠弩改变了攻击方向，在这时候路吉以村雨停止了生化铠弩的动作。“毁灭之龙”慢慢飞离了大地，地上的ZOIDS因为这一场面而停止了战斗，这时大群生化普特拉尼却追了上来……
第45话【遗产】
在生化库拉诺的帮助下，基鲁多拉龙终于来到了天空都市，但是却因为基鲁多拉龙的关系路吉一行人却被天空的人厌恶了。虽然对于基鲁多拉龙不满，但是天空议会还是遵守约定给讨伐军提供利奥制的炮弹，而重病的塞修罗也因为天空的治疗技术而得救了，哉利也被另一部份天空居民拯救了。在天空的都市里，路吉知道了在数千年发生大灾难的时候一部份人搬到了天空居住，而另一部份人则在地面进行着没意义的战争，在这场战斗中站在最前线的就是有“毁灭之龙”之称的基鲁多拉龙，所以在天空的人心中基鲁多拉龙是战斗的象征：也知道了杰列烈塔是天空都市制造的。在补充完利奥制弹药大家要离开时龙却因为反叛罪被逮捕了。
第46话【瓦解】
大量的生化普特拉尼向天空都市袭来，但是天空的居民还是没有意识到金对天空的危险性。哉利知道金是天空的居民和自己的生化铠弩上装载了吸收生命的装置后，内心发生了动摇，决定向金问明事实的真相。虽然天空拥有强大的防护罩和高性能的ZOIDS，但是在绝对数量的攻击下天空都市还是出现了损伤，甚至有人为此而死亡（天空都市从未出现过因为战斗而失去生命的情况），不得已议长向拉-坎提出了收容天空居民的请求……
无力反抗的天空都市在生化ZOIDS的攻击下，坠落了……
第47话【诀别】
消灭了“天空”的金野心无限放大了，他自称自己是超越了神的“唯一神”。在兹利拉-坎收容了失去了家乡的天空居民，天空议会的诸人在感慨被金出卖的同时却被路吉责怪他们自己也在将金当成棋子的行为。
赶回帝古的哉利发现自己的部队正在被生化ZOIDS攻击，越发疑惑的哉利回到了帝古质问金为什么在自己的生化铠弩上装载了生命吸收装置，但是金却以命令指使哉利去新的部队，疑惑的哉利在自己的部队名单上赫然看到了自己的好友威普斯的名字，疑惑之下哉利潜入了士兵宿舍，但是看到的却是一排排的机械兵，而其中一个机械兵上面刻着的正是威普斯的名字，威普斯告诉哉利，所谓的机械兵其实是利用人的灵魂驱动的ZOIDS操纵工具，并哀求哉利释放自己的灵魂哉利流泪释放了朋友的灵魂，但周围传来了更多的哀求声……哉利最后在一个小孩灵魂的笑声中决定了，他要打倒的是金！！！愤怒的哉利烧毁了ZOIDS工厂却遇上了驾驶生化库拉诺的金，已经觉醒了的哉利以ZOIDS驾驶员的身份和金展开了战斗，完全不是对手的哉利被同样厌烦了金的所作所为的维勒妮救走了。
第48话【神之雷】
在ZOIDS工厂——布劳，路吉和大家见到了机械兵的真相，路吉决定和帝加路特军合作打倒金，就在邀请帝加路特军参观机械兵的真相时，一只由生化角龙带领的却毁灭了布劳工厂——连还在生的帝加路特军士兵！对现在的帝加路特军完全失望的博兰司令建议大家到另一个工厂——卡修奇斯托发布广播。
在卡修奇斯托相会的哉利和路吉终于化敌为友，决定联手讨伐金。在卡修奇斯托发布的广播成功了，诸多的帝加路特军马上反叛了金。
在广播期间由新型生化角龙率领的ZOIDS向卡修奇斯托扑了过来，在拉-坎的掩护下大家成功逃离了，但是拉坎却消失在生化粒子炮的光芒中…….
第49话【决战】
失去了拉-坎的讨伐军都很不安，而且新加入的士兵却对路吉的能力不是很信任，路吉不得不在士兵们前演戏和帮忙以增加在士兵心中的地位，但在没人看到的时候路吉却流下了伤心的眼泪……
另一方面，金为了消灭讨伐军向大本营托拉夫直线前进，一路上所经过的城市都在“神之雷”的光芒下毁灭了。为了减少伤害，路吉决定在金前进中要经过的盆地“自由”中伏击他，在当晚路吉安慰了因拉-坎失踪而沮丧的弥抱住了她……
第二天，讨伐军出击了，路吉也取得讨伐军各人的信心。但是在伏击的时候却因为开发了新的雷达而失败了，讨伐军不得不在正面与金开战……
第50话【再生】
部份部队因为“神之雷”的恐惧而陷入了恐慌中，路吉和诸多拥有利奥武器的ZOIDS向生化提诺拉发起了进攻，但是都没有效果，而维勒妮也为了救银死在了生化提诺拉的投枪下。面对生化提诺拉的强大力量大家完全不是对手，但是哉利抓住生化提诺拉发射“神之雷”的瞬间以生化粒子炮将发射口损坏了。
破坏了“神之雷”的消息让讨伐军士气大振，但是在源源不断的增援下讨伐军却渐渐陷入了困境中。索路泰卡、迪特利空、凌波嘉克、班布里亚，一台台ZOIDS都倒在了敌人的攻击下，连无限长牙狮也被破坏了心脏。为了保护路吉的弥驾驶着蓝斯塔古冲入了战场中，但是一台兰斯塔古却完全不是对手，眼看弥就要被生化提诺拉咬碎，村雨在路吉想保护弥的意志下再生了，想用哉利和卡拉卡做盾牌的金却被索德乌鲁夫斩断了生化提诺拉的双手而被无限长牙狮贯穿了……
金倒下的同时在无数灵魂的光芒中，“金讨伐军”在这名为“自由”（真是好名字啊）的盆地中取得了胜利。
但是，一起都还没有结束，要做的是还有很多，未来与明天还在等待着大家……
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本帖最后由 xiaofeimk2 于 2009-6-5 20:37 编辑 ]
