第二部、机器人统治者

2029年，一支神秘的舰队突然出现在守备空虚的太阳系，并迅速向地球接近。这些异星人就是来自泰洛星的机器人统治者（The Robotech Masters），当年的天顶星舰队即是遵照其意志行动的奴仆。 他们统治着众多的合成人，虽然表面上看这些三位一体的异人像是缩小化的天顶星战士，但实际上他们却掌握着远比天顶星文明更先进的技术，还拥有“史前能量”所特有的“音乐”。他们为寻找多年前被泰洛科学家佐尔送出帝国的史前能量而来到太阳系。在与因维人的长年战争中他们损耗了太多能量，而天顶星人的覆灭使他们不得不亲自出马。2014年太空堡垒I号和凯龙旗舰相撞所释放出来的巨大的史前能量，使他们从遥远的星海彼端感知到这次能量大爆发，经过15年的航行，泰洛长老的舰队终于抵达了这宇宙中最后一批史前能量的所在之地——地球。

机器人统治者并不像天顶星人那样嗜杀成性，他们只想寻找被地球人忽视的史前能量，但如果地球人拒不交出史前能量，那么他们将不惜毁灭整个地球。遗憾的是饱受创伤的人类拥有太强的自卫意识，月面基地阿波罗的驻军直接向外星舰队发起攻击。第二次宇宙大战爆发。

此时在地球上最具实力的就是辖区包括太空堡垒I号遗址所在地的南十字军（Southern Cross)。军部最高司令莱纳德将军专制而刚愎自用，但军队中一大批年轻战士担当起了保卫家园的重任。其中，当年麦克斯和米丽亚的长女，也是第一个星际混血儿——戴纳·斯特林，出类拔萃，从此登上了星际军事舞台。

戴纳·斯特林和她带领的阿尔法战术装甲部队第15小队勇猛善战，成为一次次战斗的胜利者，与他们共同奋战的还有战术装甲空军、宪兵总队等部队的英雄儿女们。两个种族在交互过程中互相探底，机器人统治者发现自己低估了人类的实力。经过慎重考虑，他们下了一着险棋，将古代佐尔的克隆体——原先只担任生化军队战斗指挥官的佐尔·普莱姆送入地球人中间，以探寻人类的军事机密以及史前能量的真实情况。

佐尔·普莱姆在不知情的情况下成为机器人统治者安插在人类中的间谍。在15小队中他倍受戴纳的关注。因为他们俩之间有着跨越时空的千丝万缕的关系。围绕着这个神秘的外星人发生了一系列矛盾纠纷，他成为揭开史前能量之迷的关键。

另一方面，机器人统治者正同时为日益枯萎的史前能量和自身社会的不稳定性而烦恼不已。他们的社会以三位一体为结构，看似稳固，实则脆弱，他们赖以安定民心巩固统治的法宝——弹奏思维“音乐”的缪西卡三姐妹出现了不安定因素：缪西卡由于和地球战士鲍威尔相识相爱而产生了脱离三位一体的念头。

惨烈的大战末尾，由于南十字军最高指挥部内部的互相倾轧，最高指挥官的决策失误，人类又一次面临全灭的险境。但最终强大无比的外星人舰队在爱情这一催化剂中毁灭于内在危机的大爆发：缪西卡跟随鲍威尔脱离泰洛舰队投奔地球，三位一体社会开始土崩瓦解；战斗中佐尔·普莱姆和戴纳相爱，终于恢复了他被复制的记忆和他本身的自我，史前能量秘密真相大白，佐尔·普莱姆背叛了机器人统治者，在最后时刻启动自爆，与泰洛旗舰同归于尽。

第二次宇宙大战结束，机器人统治者舰队全灭，南十字军也遭受了沉重打击，一蹶不振。身心俱疲的人们再度开始了漫长的重建。然而他们并没有意识到，泰洛旗舰自爆的同时，撞毁了太空堡垒I号残骸中的主引擎，其中隐藏的史前能量随着太空毒花的飘散而四处远播。散发的能量吸引了广阔宇宙中另一角落的某一道目光，人类今后的道路将愈加艰难……